2015 - 2016

Lessons at Bioinformatics IUT.

Perl Orienté Objet et BioPerl

Cours

• Divers
• Rappels (PDF, Notebook)
• Perl orienté objet (PDF, Notebook)
• BioPerl (PDF, Notebook)

Travaux Pratiques

• Sujet
• Modèles
  • Compte-rendu
  • Script Perl
  • Classe Perl
• Données (par binôme)
  • Binôme 1
  • Binôme 2
  • Binôme 3
  • Binôme 4
  • Binôme 5
  • Binôme 6
  • Binôme 7
  • Binôme 8
  • Binôme 9
  • Binôme 10
  • Binôme 11
  • Binôme 12
  • Binôme 13
  • Binôme 14
  • Binôme 15
  • Binôme 16
  • Binôme 17
• Scripts R
  • plot_quality_scores.R
  • plot_sequence_length.R

Métagénomiques

Cours

• Divers
• Séquençage (PDF)
• Métagénomique (PDF)

Travaux Pratiques

• Sujet
• Modèle
  • Compte-rendu
• Données (par binôme)
  • Binôme 1 : Patient TS50
  • Binôme 2 : Patient TS2
  • Binôme 3 : Patient TS3
  • Binôme 4 : Patient TS4
  • Binôme 5 : Patient TS5
  • Binôme 6 : Patient TS6
  • Binôme 7 : Patient TS7
  • Binôme 8 : Patient TS8
  • Binôme 9 : Patient TS9
  • Binôme 10 : Patient TS19
  • Binôme 11 : Patient TS20
  • Binôme 12 : Patient TS21
  • Binôme 13 : Patient TS30
  • Binôme 14 : Patient TS49
  • Binôme 15 : Patient TS51
  • Binôme 16 : Patient TS50
  • Binôme 17 : Patient TS5